原核轉錄組測序是基于Illumina測序平臺,構建鏈特異性文庫,研究原核生物在某個時期或者在某種環境條件下轉錄出來的所有mRNA,從而找出關鍵功能基因。由于原核生物mRNA沒有polyA尾結構,需要采用去除rRNA的方法構建文庫。

技術路線

技術路線

分析內容

    1. 數據過濾與統計
    2. 參考序列比對分析
        2.1 比對結果統計
        2.2 比對結果可視化
        2.3 基因組區域分布
        2.4 轉錄組整體質量評估
    3. 新轉錄本預測
    4. 基因表達量分析
        4.1 不同樣品表達量對比
        4.2 樣本相關性分析
        4.3 樣品主成分分析
    5. 基因表達差異分析
        5.1 差異表達分析
        5.2 組間差異基因venn/花瓣圖
        5.3 差異基因表達M-A 圖
        5.4 差異基因表達火山圖
        5.5 差異基因聚類熱圖
    6. 差異基因GO 和KEGG 富集分析
        6.1 差異表達基因GO 富集分析
        6.2 差異表達基因KEGG 富集分析

案例解析

人類腸道共生菌調節自身免疫
本研究通過轉錄組測序技術,分別在體外和小鼠模型中研究了Roseburia hominis和宿主細胞的信號轉導機制,結果表明Roseburia hominis和宿主細胞之間存在特殊的雙向基因表達模型,可用于控制和治療腸道炎癥。


參考文獻:
Patterson AM, Mulder IE, et al. Human Gut Symbiont Roseburia hominis Promotes and Regulates Innate Immunity. Frontiers in Immunology, 2017.

訂購與咨詢

您可以通過以下任意方式下單或咨詢,工作時間我們保證在1小時內給您反饋:

  1. Email:將您的需求填寫完整后發送到support@synbio-tech.com
  2. 電話訂購:工作日您可以撥打免費熱線4000-973-630(按1);休息日您可直接撥打18262686586聯系我們
  3. 在線咨詢:您有任何技術問題均可與我們進行網頁在線互動